刘备一直担心曹军会突出奇兵奇袭樊口，毕竟曹操颇看的起自己，所以一直以来坐卧不宁。其实曹操还真的打算令虎豹骑奇袭樊口，一举灭掉刘备这颗小卫星。不过令曹操始料未及的是素擅征伐的虎豹骑一到了南方便成了病猫，最初还能吃些肉食，到后来便连肉也吃不下了，接着便是一片片的病倒。而从北方带来的战马也和老虎、豹子一样，一到了这江南水乡便爬不起来了。初时是对南方的草料完全没感觉，为了解决饮食问题，曹军还从北方运来饲料。入了荆州，从北方带来的马便成片成片的倒（荆州的干草，这些马是一口也不动的。既然不吃荆州的干草，那就喂精饲料吧，反正按原有马匹数量分配怎么配都不超标。谁知这精饲料反成了这些战马的催命符，战马反而倒的更快）。战马倒了也就算了，就连虎豹骑中这些百万军中精挑细选出来的虎豹骑也接连着倒了下去。原因为何？自然也是水土不服。连虎豹勇士都病了，更何况曹军的普通部队呢？
  曹军的“畜流感”、“人流感”不仅是引起了当时曹操军中的高层关注，就连一千八百年后的诸多传染病、地方病、流行病也开始关心起了曹军战士的身体健康！无数医学专家、学者深入三国历史这片广茅之地，试图插上一脚，什么霍乱、出血热、菲疔、禽流感？一时间众说纷纭，百花齐放，映的满天金光乱闪，更有位姓李的教授断言是曹军感染了血吸虫病。其实史书上对此记载也就无非一句短短的“……于是大疫，吏士多死……”就凭这么短短几个字能说明什么病？由此可见，不过是一群卖弄知识忽悠大众的道貌岸然的伪君子罢了。
  其实就是现在的北方人到了南方也多有水土不服，更何况一千八百多年前的人了？那时的环境南北之分要明显的多，气候差异也要大的多，水土不服自然是不足为奇，哪里还用的上血吸虫这类专业病毒？再加上长江风高浪大，对于不习水性的曹军而言，不上吐下泻才怪。而曹操为了不影响南下，自然会将病倒的曹军放到船上运输，这样一来，曹军的病情反而加重了。
  一时间曹操一贯引以为豪的兵贵神速自然也神速不起来了，万般无奈下曹操只好放弃了奇袭突击，改为步步为营向前推进。
  可是，即便如此，曹军晕船、水土不服的情况并没有丝毫的好转。
  很快，这些北方雄师不但没了往日的风采，反而成了被保护的对象。被谁保护？自然是南方刘表留下的荆州兵。
  这些荆州兵与东吴兵隔江对峙多年，一向恃勇不惧东吴兵，两军大小战役上百次，虽然败多胜少，但自孙坚被黄祖的江夏军射杀后，荆州兵便有了一种莫名的优越感。而且荆州兵对长江风浪早已习已为常，在江上行走如履平地，与曹军水师一比，高下立判。
  这真伤坏了曹操的脑子，毕竟刚收荆州，荆州军并不可靠。何况眼下荆州旧主刘琦、刘备还在江夏。
  荆州兵刚投降便要与旧主一决生死，于情于理也难保有些人会临阵倒戈（刘表虽然死了，但积威犹在。想那刘表在时，对百姓爱戴有加，将荆襄治理的井井有条，荆襄百姓一直对刘表敬若在生父母。刘琦是其亲子，爱屋及乌，自然对刘琦也别有情义）。
  曹操不得不在荆州兵中各船安排监军，为了稳妥，又将荆州军与曹军混编在一起，以控制荆州军。
  本来这个想法不错，可是一经实施便暴露了问题。曹军踏上战船上吐下泻这些小毛病就不算了，行船时，一旦遇到稍大一点的风浪，大部分曹军就只能扶着船桅坐在船上，连站都站不起来，更别说打仗了，基本上是完全失去了战斗力。
  这样一来，反倒成了荆州兵的累赘，成为荆州兵的笑柄。而曹军毕竟是曹操的嫡系部队，荆州兵是降军，这些曹军跋扈惯了，哪会把降兵放在眼里，冲突倒日渐加重了。
  曹操无奈，只好将曹军全部撤了下来，清一色换成了荆州兵马。而荆州水军自然由蔡瑁、张允统领，不过曹操对这二将一直心存疑虑。二人虽是在荆州献降上做出了大贡献，但听程昱说，这两人与诸葛亮关系匪浅。程昱虽然说的含糊其辞，但曹操清楚这已经说明了一个问题，这几个人很有可能在仙界便是朋友关系，如此一来，曹操怎能放心？所以曹操特意安排了于禁作水军督军。
  有很多人可能奇怪，为什么曹军一定要舍了自己擅长陆战而打自己完全不适应的水战呢？
  其实许多人可能都有一个误区，以为赤壁之战曹操的目的是渡江。其实当时的曹操已夺取了南郡（江陵），招降了原刘表的水军，渡江南下根本不成问题。但是当时曹操的敌人不在江南的长沙，而是长江下游江夏（武汉）的刘备和柴桑（九江）、江东的孙权。如果曹操选择从陆路顺江直下，会遇到极大的阻力。
  当时的长江中下游两岸有大量的湖泊沼泽，这些湖泊沼泽外又是大量丘陵山地，极不利于大部队陆上行进。
  所以，曹操自然选择简单的乘船顺江而下抢摊登陆。曹操顺流而下的船队在赤壁与溯江而上的周喻相遇，周喻选择靠南岸扎营，曹操自然会在上游的北岸扎营，这样阵营分明可以防止对方的偷袭。而周喻并不担心曹操会甩开自己直接顺江而下，因为如果曹操挥师南下周喻就可以在中途截击曹操的后队。
  而如果曹操渡江到对岸打陆战，一来当地的地形（湖泊沼泽）不允许，二来渡江部队如果被东吴水军截断后路也会陷入重围被歼灭。
  事实上，赤壁之战时的周喻确实有派部队到北岸截击曹操的后路。所以，曹操只有在赤壁与东吴水军会战，击破东吴水军后，才能放心顺江而下。